Eine vielfältige Fruchtfolge bietet ackerbauliche und phytosanitäre Vorteile und eröffnet Chancen im Betrieb der Biogasanlage. Außerdem trägt sie zu einer positiven Wahrnehmung bei.
Geänderte rechtliche Rahmenbedingungen bei der Biogasproduktion bewirken, dass der Einsatz des Rohstoffs Mais durch den Maisdeckel schrittweise reduziert wird. Die Koppelnutzung von Körnermaisstroh fällt allerdings nicht unter den Maisdeckel.
Alternative Kulturarten wie Zuckerrüben, GPS-Roggen und Sorghum werden zunehmend interessanter zur Verwendung als Substrat und vermehrt angebaut. Eine breite Kulturpalette bietet mehr Flexibilität und ermöglicht es, sich an wandelnde Umweltfaktoren, Bewirtschaftungsauflagen und -notwendigkeiten anzupassen.